Материалов:
1 005 012

Репозиториев:
30

Авторов:
761 409

Функциональное исследование организации генного окружения транспозонов хелитронов в геномах Bos taurus

Дата публикации: 2017

Дата публикации в реестре: 2020-03-13T23:42:41Z

Аннотация:

Мобильные элементы (МЭ) являются хорошо известными факторами геномной изменчивости и эволюции. Будучи важными источниками регуляторных элементов, МЭ способны оказывать существенное влияние на архитектуру и экспрессию генома хозяина. В настоящее время особый интерес вызывает исследование ДНК транспозонов хелитронов. Предполагается, что хелитроны вовлечены в горизонтальный перенос генетического материала между удаленными таксонами и способны значительно повлиять на геном хозяина за счет механизмов перетасовки экзонов (exon-shuffling) и «захвата» генов (gene capture). Благодаря этому и в связи с высоким уровнем полиморфизма и относительно высокой плотностью в геномах эукариот, хелитроны могут быть использованы в качестве «якорей» для геномного сканирования различных пород сельскохозяйственных животных с целью выявления их генофондного стандарта. В настоящее время не существует комплексных исследований, посвященных хелитронам и их взаимодействию и влиянию на геномный ландшафт крупного рогатого скота (Bos taurus). Ранее нами была показана возможность использования консенсусной последовательности 3'-конца хелитронов семейства Heligloria для полилокусного генотипирования (геномного сканирования) с целью оценки консолидированности разных пород крупного рогатого скота. В настоящем исследовании для изучения контекстных особенностей участков ДНК, фланкированных инвертированными повторами фрагментов хелитронов Heligloria, были секвенированы подобные геномные участки (около 550 п.н.), принадлежащие трем породам крупного рогатого скота, и проанализированы функциональные особенности выявленных генов. Таким образом, в данной работе представлена функциональная организация генного окружения транспозонов хелитронов в геномах разных пород Bos taurus и обсуждается возможное влияние подобного распределения хелитронов на геномы исследованных групп животных

Тип: Journal Article


Связанные документы (рекомендация CORE)