Статья посвящена рассмотрению методологий подходов по прогнозированию рисков в сфере эколого-экономической безопасности на уровне региона. Рассмотрено понятие экологической и эколого-экономической безопасности и взаимное влияние экономики и экологии в рамках региона. Представлено три методики оценки эколого-экономической безопасности с технологией расчета показателей. Рассмотрены следующие методики: индекс скорректированных чистых накоплений, сводный индекс общероссийской общественной организации «Зеленый патруль» и экологически адаптированный чистый внутренний продукт.