В данной работе предлагается метод генерации 3D моделей систем раковых клеток из флуоресцентных изображений. Реализованы улучшенный алгоритм определения границ объектов изображения методом водораздела, использующего маркеры, метод интерполяции форм клеток на основе кривых Безье и процедура аппроксимации форм 3D моделей систем раковых клеток. Разработанные алгоритмы интегрированы в программный пакет.