Обсуждается существование микробной петли в пелагиали в связи как с гидрологическими и
метеорологическими факторами, так и с состоянием планктона в разные сезоны в оз. Байкал.
Условия, в которых происходит таяние льда и ход весеннего развития планктона, указывают
на наличие сильной связи между фитопланктоном и бактериями. Тем не менее отсутствие
данных по микрозоопланктону и появляющиеся сообщения о роли разных групп, вовлеченных в
микробиальную петлю, затрудняют получение общей картины потоков вещества в озере. Кроме
того, скорость погружения диатомовых водорослей не дает возможности реминерализации
планктонных углерода и азота в фотическом слое. Таким образом, минерализованные
бактериями биогенные вещества долгое время пребывают в абиссали озера, что и может
приводить к олиготрофности верхних слоев.