Дата публикации: 2017

Дата публикации в реестре: 2020-03-03T18:50:21Z

Аннотация:

Глубинная подземная биосфера является одной из наименее изученных экосистем на Земле, содержащих сообщества экстремофильных микроорганизмов. Целью работы являлась молекулярная характеристика микробных сообществ подземных термальных вод Западно-Сибирского региона, залегающих на глубинах 2-3 км. Отбор проб воды проводили из нефтепоисковой скважины 5Р, пробуренной до глубины 2.8 км, в районе пос. Чажемто Томской области. Вода имела температуру около 20°С, нейтральный pH и низкий окислительно-восстановительный потенциал (-304 mV). Подземные резервуары имеют сложную структуру и могут содержать как "планктонные", так и иммобилизованные на поверхности пород в виде биопленок микроорганизмы, которые могут эпизодически вымываться и детектироваться в вытекающей из скважины воде. Мы провели анализ состава сообщества с помощью амплификации и пиросеквенирования фрагментов генов 16S рРНК, проанализировав семь проб воды, отобранных в различные моменты времени в течение 26 ч. Бактерии, составлявшие около половины сообщества, были представлены в основном некультивируемыми линиями филумов Firmicutes, Ignavibacteria, Chloroflexi, Bacteroidetes и Proteobacteria, а археи относились, в основном, к известным метаногенам родов Methanothermobacter, Methanosaeta и Methanomas-siliicoccus. Анализ образцов, отобранных в различные моменты времени выявил большие вариации в содержании большинства групп бактерий, причем снижение содержания Firmicutes сопровождалось увеличением долей Ignavibacteria и Chloroflexi. Доля архей рода Methanothermobacter в течение суток изменялись незначительно, а для филотипов, отнесенных к Methanosaeta и Methanomassiliicoccus, наблюдались значительные вариации. По-видимому, гидрогенотрофные археи рода Methanothermobacter являются постоянной компонентой микробного сообщества и образуют его "планктонную" составляющую, а большая часть идентифицированных групп бактерий присутствует в биопленках или пространственно локализованных участках подземного водного резервуара, материал которых периодически поступает в скважину.

Тип: статьи в журналах

Источник: Микробиология. 2017. Т. 86, № 6. С. 739-747