В статье осуществлен анализ комплексного мониторинга экосистем на особо охраняемых природных территориях (ООПТ) на основе оценки состояния экосистем, выявления механизмов сохранения биологического и ландшафтного разнообразия ООПТ, рационального использования природных ресурсов этих территорий и оценки эффективности режимов их охраны и использования. Анализ проведен на примере НП «Беловежская пуща» на основе выявления факторов, оказывающих вредное воздействие на состояние экосистем.