В статье представлен анализ основных методологических подходов к оценке устойчивого развития систем различного уровня (национальной и региональной экономики, территорий, отраслей, предприятий, продуктов). Проведена систематизация подходов и инструментов, используемых учеными разных стран, международными организациями и институтами. Указаны преимущества, недостатки и ограничения практического применения выделенных методологических подходов. Изложена суть метода TOPSIS как инструмента оценки устойчивости развития территорий с учетом мультипликативных эффектов от межрегионального и межотраслевого взаимодействия. Показано, что именно кластерный подход является эффективным инструментом управления устойчивым развитием территориальных систем.