Исследование полиморфных вариантов генов цитокинов IL-4 и IL-10 у детей с бронхиальной астмой : дипломная работа (проект) специалиста по направлению подготовки: 30.05.01 - Медицинская биохимия
АННОТАЦИЯ Выпускная квалификационная работа на тему Исследование функциональных полиморфизмов генов цитокинов IL-4 и IL-10 у детей с бронхиальной астмой Школа биомедицины, Департамент медицинской биохимии и биофизики Автор: Еремеев Вячеслав Игоревич Руководители ВКР: к.м.н. зав. ЛМБХ ТИБОХ ДВО РАН Исаева М.П. асс. каф. ФГБОУ ВО ТГМУ Долгополов М.С. 1. Цели и задачи работы Цель: исследовать влияние функциональных полиморфизмов генов IL4 и IL10 на формирование атопического варианта бронхиальной астмы. Задачи: 1. Сформировать банк ДНК из периферической крови больных БА и здоровых. 2. Исследовать распределение аллелей и генотипов полиморфного варианта C–589T гена интерлейкина-4 у детей с БА и в группе сравнения. 3. Исследовать распределения аллелей и генотипов полиморфных вариантов A–1082G, C–592A и C–819T гена интелейкина-10 у детей с БА и в группе сравнения. 4. Оценить прогностическую значимость генетических полиморфизмов исследуемых цитокинов в развитии БА. 5. Определить сочетанное влияние генетических полиморфизмов исследуемых генов на риск развития БА. 2. Методология работы и эмпирическая база Клиническая группа состояла из 82 пациентов с верифицированным диагнозом БА, находившихся на диспансерном учете в КГБУЗ «Владивостокский диагностический центр» (гл. врач Кабиева А.А.). Контрольная группа состояла из 36 здоровых детей. Диагностика БА производилась по данным наследственного анамнеза, истории болезни, уровню общего и специфического IgE. Выделение ДНК из образцов венозной крови осуществлялось на базе кафедры клинической лабораторной диагностики, общей и клинической иммунологии ФГБОУ ВО ТГМУ (зав. Кафедрой, д.м.н., проф. Просекова Е.В.) при помощи набора High Pure PCR Template Preparation Kit (Roche, Швейцария). Контроль качества и количества выделенной ДНК осуществлялся при помощи электрофореза в агарозном геле, а также спектрофотометрически. Для выявления ОНП применялся метод аллель-специфической ПЦР с использованием наборов производства Литех, Россия. Детекция результатов производилась методом электрофореза в агарозном геле. Для статистического анализа использовались программное обеспечение PLINK, Epi Info 7.2.4, STATISTICA 13 и Haploview 4.2. Исследуемая популяция проверялась на соответствие закону Харди-Ванйберга. В ходе статистического анализа результатов генетического обследования производился подсчет отношений шансов с 95% доверительным интервалом, X2 Пирсона, теста на тенденцию за авторством Cochran-Armitage и критерия статистической достоверности (p). Для разделения клинической популяции на подгруппы применялся непараметрический U-критерий Манна-Уитни. Частоты гаплотипов анализировались с использованием Haploview 4.2. 3. Основные результаты и возможности их практического применения. При проведении генотипирования детской популяции Приморского края на предмет наличия связей между полиморфными вариантами SNP IL-4 C– 589T, IL-10 A-1082G, IL-10 C-819T и IL-10 C-592A и риском развития БА были обнаружены нетипичные ассоциации, требующие проведения более масштабных исследований. Клиническая группа продемонстрировала гетерогенность по уровню общего и специфического IgE, вследствие чего была разделена на атопическую и вирус-индуцированную подгруппы. Генотип CA полиморфизма IL-10 C-592A по результатам проведенной работы можно считать фактором риска развития атопического варианта БА, а IL-4 C– 589T и IL-10 C-819T можно обозначить как потенциальные факторы риска. Не было обнаружено зависимости между различными гаплотипами означенных полиморфизмов и риском развития БА во всех рассмотренных сочетаниях. Полученные результаты могут быть использованы в дальнейшем в разработке универсальной диагностической тест-системы для выявления генетических факторов риска бронхиальной астмы.