Целью представленной работы является развитие методических основ оценки инновационно-инвестиционных проектов (ИИП) для их отбора с целью финансирования в контексте приоритетных задач развития экономики региона. В качестве методов исследования использованы: анализ и синтез, сравнительный анализ, экономико-статистический метод, метод весовых коэффициентов. Для достижения цели исследования поставлены следующие задачи: обобщить понятия инновационных и инвестиционных проектов; предложить комплексный подход к оценке инновационно-инвестиционных проектов с целью финансирования; проанализировать инвестиционные возможности Томской области. В ходе изучения научной литературы были обобщены понятия инвестиционных и инновационных проектов. Предложен подход к оценке проектов, учитывающий инновационно-инвестиционные приоритеты на региональном уровне. В работе дана оценка потенциала регионов Сибирского федерального округа в области осуществления ИИП, которая показала наличие условий для успешной их реализации и получения отдачи в конкурентоспособных отраслях Томской области.