Автоматическое определение открытых рамок считывания в молекулах РНК человека с использованием алгоритмов векторизации и классификации

Яцков, Н. Н.; Скакун, В. В.; Гринев, В. В.

Автоматическое определение открытых рамок считывания в молекулах РНК человека с использованием алгоритмов векторизации и классификации

Яцков, Н. Н., Скакун, В. В., Гринев, В. В.

Дата публикации: 2019

Дата публикации в реестре: 2021-08-05T17:48:31Z

Аннотация:

Разработан вычислительный подход для автоматического определения открытых рамок считывания в большом наборе молекул РНК на основе алгоритмов векторизации нуклеотидных последовательностей и классификации (случайного леса). Проверка работоспособности алгоритмов выполнена на двух наборах молекул РНК из баз данных NCBI RefSeq и Ensembl. Точность определения открытых рамок считывания составляет 98,14%.

Ключевые слова:
материалы конференций, полнотранскриптомное секвенирование, открытые рамки считывания

Тип: Статья