В статье рассмотрены понятие и структура финансового механизма здравоохранения России, проведен анализ и выявлены основные проблемы при финансировании системы здравоохранения, предложен алгоритм отбора проектов для совершенствования системы здравоохранения России на основе государственно-частного партнерства.