Установлено, что резидентные макрофаги на примере клеток Купфера и моноциты различаются по профилю экспрессируемых генов. Однако это не позволяет отнести однозначно резидентные макрофаги печени к М2-макрофагам, а моноциты - к клеткам с М1-фенотипом. При этом у клеток Купфера обнаружено значительное количество генов с повышенной экспрессией, которые связаны с регуляцией функций печени в норме: Arg1 , Flt , iNos , Kng1 . У моноцитов также обнаружено большое число генов с повышенной по сравнению с клетками Купфера экспрессией: Alox15 , Alox12 , Tlr2 , Tlr4 , Tlr7 , Tlr8 , которые относятся к типичным функциональным генам макрофагов.