В работе представлена методология "сквозного" преподавания специальных дисциплин энергетического профиля с использованием многофункциональной системы MATLAB и ее приложений FEMLAB и SIMULINK. В основу этой методологии положен учебно-методический комплекс "Моделирование и оптимизация тепломассообменных процессов".