Научная статья посвящена анализу проблемных вопросов лицензирования медицинских организаций, оказывающих медицинскую помощь больным с врожденными и (или) наследственными заболеваниями на современном этапе. Автором предлагается внесение изменений в некоторые нормативные правовые акты в целях совершенствования процедуры лицензирования медицинских организаций, оказывающих медицинскую помощь больным с врожденными и (или) наследственными заболеваниями и предупреждения в дальнейшем роста судебной практики по привлечению к административной ответственности медицинских организаций за несоблюдение лицензионных требований организациями, оказывающими медицинскую помощь больным с врожденными и (или) наследственными заболеваниями.