В рукописи приведены данные о роли пробиотической микрофлоры в формировании колонизационной резистентности организма животных. Показано, что микробиоту различных биотопов животного необходимо рассматривать, как неотъемлемую часть внутренней экосистемы, формирующей колонизационную резистентность организма и выполняющей функции отдельного органа. Микробиота активно взаимодействует со всеми органами и системами организма, формируя его гомеостаз, определяя благоприятное функционирование в норме, так и при развитии патологических состояний. При нарушениях микробиома в биотопах организма животных, которые могут возникнуть при различных заболеваниях, нерациональной антибиотико-терапии, неполноценном кормлении и неблагоприятном содержании, необходимо проводить своевременную диагностику и коррекцию.