В статье определяются ключевые понятия о качестве вод и устойчивости экосистем. Показано, что без глубокого изучения формирования свойств вод и устойчивого функционирования экосистем невозможно предложить как адекватную систему мониторинга водных экосистем, так и предотвратить разрушающее действие на природу антропогенных факторов. Утверждается, что человечество имеет три варианта выбора относительно дальнейшего состояния природных экосистем: 1) продолжение разрушающего воздействия в современных масштабах; 2) полное прекращение воздействия и восстановление до природного состояния; 3) восстановление основных показателей и поддержание устойчивого функционирования экосистем. Очевидно, что первая позиция неприемлема, вторая — требует больших финансовых затрат и может рассматриваться для отдельных, особо охраняемых водных экосистем. Последняя позиция может быть принята для большинства водных объектов в регионах антропогенной деятельности.
Работа выполнена при финансовой поддержке Правительства Российской Федерации, постановление № 220 от 9 апреля 2010 г. «О мерах по привлечению ведущих ученых в российские образовательные учреждения высшего профессионального образования» (договор № 11.G34.31.0036 от 25.11.2010 г.).