В морфометрических исследованиях широко распространён автоматический способ получения координат ландмарок. Подход автоматического получения координат ландмарок совокупности произвольно расположенных объектов на одном цифровом изображении позволяет значительно ускорить процесс подготовки и морфометрической обработки данных. Особенностью подхода является
предварительная морфометрическая обработка контурных полуметок каждого из произвольно
расположенных измеряемых объектов. Рассчитываются нормализованное расположение и размеры
сопоставляемых объектов методом Прокрустовой суперпозиции, в котором некоторые его этапы реализованы особым образом. Рассматривается способ нормализации выделенных объектов изображения, который заключается в распознавании отдельных объектов изображения; повороте главной оси эллипса объекта в вертикальное расположение; отражении массивов контурных полуметок по условию заданного баланса площадей; масштабировании – приведение к относительным значениям координат. Морфометрический инструмент представляет собой программную реализацию рассмотренного подхода. С его помощью выполнена автоматическая предварительная морфометрическая обработка пальчато- и перисто-рассечённых листовых пластинок, результаты представлены в форме характерной для Прокрустовой суперпозиции. Морфометрический инструмент позволяет получить гомогенизированные координаты ландмарок после предварительной обработки, что позволяет сразу проводить стандартную статистическую обработку данных. Подход можно использовать в дополнение к широко используемому Прокрустову методу, при разработке программного обеспечения морфометрического анализа.