При подготовке материалов статьи использованы показатели, отражающие состояние системы управлением логистикой в компаниях электронной коммерции. Целью исследования выступает анализ современных теорий управления логистикой в компаниях электронной коммерции, выявление этапов формирования и применения инструментов управления. В ходе данного исследования использованы результаты различных исследований и мнения ряда экспертов по данной теме. Представлены примеры применения сформулированных инструментов и показана важность этих результатов в новую цифровую эпоху. В статье обоснована эффективность инструментов управления бизнес-процессами в данной сфере деятельности.