Дата публикации в реестре: 2024-10-01T15:39:33Z

Аннотация:

Растительная клеточная стенка представляет собой внешний компартмент растительной клетки, который во многом обеспечивает физический барьер и запуск сигнальных каскадов при действии био- и абиотических стрессоров. Засуха негативно влияет как на рост, так и развитие растений. Белки клеточной стенки (БКС) играют существенную роль в ответе растений на водный дефицит. Механизмы адаптации клеточной стенки к потере воды могут быть использованы для выявления важных генетических факторов, определяющих устойчивость растений к засухе, и предоставляют ценные данные о биомаркерах для дальнейшей селекции, направленной на повышение урожайности культурных растений. С помощью ANDSystem реконструирована генная сеть, позволяющая описывать регуляцию БКС в условиях ограничения полива. Анализ генной сети совместно с анализом транскриптомных данных позволил провести приоритизацию транскрипционных факторов (ТФ) по их обогащенности регулируемыми дифференциально экспрессирующимися генами. В результате были рассчитаны веса, являющиеся индикаторами ассоциации ТФ с водным дефицитом. По значениям весов отобраны восемь наиболее значимых ТФ. Наибольшим приоритетом обладал ТФ GBF3. Приоритизация БКС проведена по критерию суммирования весов транскрипционных факторов, регулирующих эти гены. К наиболее приоритетным БКС отнесены ген AT5G03350 , кодирующий лектин-подобный белок; AT4G20860 , кодирующий фермент берберинового моста BBE-like 22 (berberine bridge enzyme-like 22), необходимый для окисления продуктов распада целлюлозы, и AT4G37800 , кодирующий ксилоглюкан эндотрансгликозилазу/гидролазу 7.

Тип: Article

Источник: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii