Химический состав рек Южного Кыргызстана в значительной степени формируется под влиянием естественных факторов, а также под воздействием загрязнений, поступающих, с неорганизованными сточными водами городов и поселков. В статье рассматривается территория, входящая в бассейн р. Сырдарьи, дается гидрохимическая характеристика крупных рек, входящих в данный бассейн.