Проведен анализ деятельности органов публичной администрации по выявлению проблем и противоречий современного административного законодательства в сфере природопользования. Организация взаимоотношений федерального министерства и подведомственных ему федеральных служб и агентств требует более детального регулирования, в том числе и в положениях об этих органах исполнительной власти. Одной из особенностей правового статуса федеральных служб, находящихся в ведении Минприроды России, Минэкономразвития России является то, что нахождение федеральных служб в непосредственном ведении министерств предполагает наделение последних важными организационными, финансово-бюджетными и контрольными функциями в отношении подчиненных им федеральных служб. Даются предложения по оптимальному их решению, выявлена необходимость дополнить, изменить формулировки, изложить в соответствующей редакции ряд статей КоАП РФ, внести изменения в положения о государственном надзоре в сфере недропользования, о государственном земельном и лесном надзоре.