В статье авторы предлагают свое видение учебно-методического комплекса по курсу моделирования социо-эколого-экономических систем. Одной из острых проблем в современной России является проблема адекватного учета социо-эколого-экономических факторов на всех стадиях проектного цикла - от проекта до рекультивации. Учет данных факторов обеспечивается законодательно при оценке современного состояния окружающей среды, оценке воздействия на окружающую среду, экологическом аудите в разных форматах и экологическом мониторинге на разных стадиях проектного цикла Предлагаемый курс направлен на подготовку специалистов, владеющих навыками системного мышления, в том числе руководителей предприятий и экологических аудиторов. Основной целью курса является научение студентов основам системного мышления при решении задач управления в различных областях человеческой деятельности, применению методов имитационного моделирования в экологии, а также использованию программных средств поддержки методов моделирования и анализа исследуемых систем.