Антигенные кластеры трансмембранных и капсидных белков вируса артрита-энцефалита коз и их биоинформационный анализ

Мукминов Малик Нилович; Шуралев Эдуард Аркадьевич; Покровская Екатерина Сергеевна; Фаизов Тагир Хадиевич; Елизарова Инна Анатольевна

Антигенные кластеры трансмембранных и капсидных белков вируса артрита-энцефалита коз и их биоинформационный анализ

Мукминов Малик Нилович, Шуралев Эдуард Аркадьевич, Покровская Екатерина Сергеевна, Фаизов Тагир Хадиевич, Елизарова Инна Анатольевна

Дата публикации: 2015

Дата публикации в реестре: 2020-02-29T22:56:57Z

Аннотация:

Методами биоинформационного анализа были исследованы антигенные детерминанты белков вируса артрита-энцефалита коз. В результате были обнаружены две специфические указанному вирусу группы: эпитопы белков, кодируемых геном env, и эпитопы белков, кодируемых геном gag. Было установлено, что наибольшую диагностическую ценность представили два эпитопа трансмембранного белка ТМ gp38 и один - капсидного белка р25. Это выражается в высокой вероятности, достаточнной степени и наибольшем количестве совпадений их аминокислотных последовательностей как с белками большинства штаммов вируса артрита-энцефалита коз, так и общегрупповых лентивирусов мелкого рогатого скота.

Ключевые слова:
лентивирусы мелкого рогатого скота, ВАЭК, гликопротеины, иммуногенный эпитоп, BLAST анализ, Биология, Медицина и здравоохранение, Сельское и лесное хозяйство

Тип: Article

Права: open access