Показано, что венчурные организации, являясь субъектами инновационной инфраструктуры, отличаются от других коммерческих организаций как по составу имущества, так и по источникам его формирования. При этом в отношении данных субъектов также может подниматься вопрос о финансовом состоянии и вероятности банкротства. Но поскольку деятельность венчурных организаций специфична, существующий методический инструментарий для оценки финансового состояния и риска банкротства организаций реального сектора экономики не может быть применен в отношении их. В связи с этим, авторами предложена методика оценки удовлетворительности структуры бухгалтерского баланса венчурной организации, учитывающая специфику ее деятельности.