Внедрение новых образовательных стандартов в школе привело к необходимости пересмотреть содержание и процесс подготовки учителя в связи с изменившимися требованиями к результатам учебного процесса и, как следствие, новыми требуемыми компетенциями педагога, в том числе компетенции организовывать и сопровождать учебно-исследовательскую и проектную деятельность обучающихся. В статье рассматривается содержание и процесс подготовки будущего учителя физики при обучении в магистратуре к проектированию и организации учебно-исследовательской деятельности. Содержание подготовки по каждому компоненту профессиональной компетентности соотнесено с перечнем дисциплин, в которых реализуется подготовка в магистратуре.