Щелочные азотные гидротермы, характеризующиеся высокими значениями температуры и pH, являются экстремальными местообитаниями на территории Прибайкалья. Микробные маты представляют собой прокариотные сообщества, состоящие из фотосинтезирующих цианобактерий, а также различных аэробных и анаэробных микроорганизмов. С помощью рентгенофазового анализа (РФА) и сканирующей электронной микроскопии (СЭМ) определены минералы в микробных сообществах на выходах термальных источников Прибайкалья. Среди минералов выявлены кальцит, кварц и опал. В сероводородных источниках обнаружены отложения сульфида железа (фрамбоиды пирита), образовавшиеся в результате метаболической деятельности микроорганизмов. Кристаллы кальцита имели эллипсоидальную форму, ограненную кубическую или призматическую. Кремнезем (опал) отлагался плотной коркой с окремнением нитей цианобактерий, выявлены кремнистые образования биогенного происхождения – кремнистые чехлы на нитях цианобактерий и створки диатомовых водорослей. Микробные обрастания и маты выступают в качестве реакционных поверхностей для нуклеации гетерогенных кремниевых частиц при образовании аморфного кремнезема и опала. Кальцит формируется в результате метаболической активности организмов за счет образования локальных зон с высоким рН и образования гликокаликса (экзополисахаридов), поглощающего ионы кальция. Фрамбоиды пирита «растут» на поверхности обломков панцирей диатомовых водорослей, также встречены россыпи отдельных кристаллитов в толще микробного мата или на поверхности