В статье освещены основные проблемы, связанные с повышением эффективности управления процессом формирования знаний и умений по самоконтролю у студентов, имеющих отклонения в состоянии здоровья. Автор описывает экспериментапьное программное обеспечение для определения уровня операциональной готовности студентов по выполнению самоконтроля за физическим состоянием организма; используя современный подход компьютерной диагностики операциональной готовности студентов к выполнению самоконтроля, активизирует учебно-познавательную деятельность студентов.