Цель исследования. Обозначение проблемных вопросов оценки гигиенического состояния полости рта и клиническая проработка возможных алгоритмов их решения с использованием модифицированного нами, высокочувствительного (до 150 КОЕ/мл против 5·106-5·108 КОЕ/мл), объективного (ошибка 2-3%) метода флюоресцентной спектроскопии. Материал и методы. В клиническом исследовании с участием 20 пациентов трудоспособного возраста показано, что модифицированный авторами метод флюоресцентной спектроскопии позволяет проводить индивидуально каждому пациенту комплексную цифровую экспресс-индикацию и объективный анализ гигиенического состояния полости рта на основе экспресс-регистрации и анализа всей совокупности аэробно-анаэробной микрофлоры различных биотопов полости рта (биотоп зубов, губ, десен, щек, неба, языка и слюны) в режиме онлайн. Результаты. Получены интегральные показатели гигиенического состояния полости рта у лиц с удовлетворительной гигиеной полости рта до и после чистки зубов, описывающие гигиеническое состояние как полости рта в целом, так и отдельно взятых биотопов в их взаимосвязи. Заключение. Полученные результаты позволили обосновать более объективную количественную методику оценки гигиенического состояния полости рта для реализации индивидуально обоснованного ее клинического применения с выявлением биотопа (биотопов) рта, который является основным источником ее загрязнения.