Viscous Media Slow Down the Decay of the Key Intermediate in Bacterial Bioluminescent Reaction

Лисица, Альберт Евгеньевич; Суковатый, Лев Алексеевич; Кратасюк, Валентина Александровна; Немцева, Елена Владимировна

Viscous Media Slow Down the Decay of the Key Intermediate in Bacterial Bioluminescent Reaction

Лисица, Альберт Евгеньевич, Суковатый, Лев Алексеевич, Кратасюк, Валентина Александровна, Немцева, Елена Владимировна

Дата публикации: 2020-05

Дата публикации в реестре: 2021-09-06T14:29:56Z

Аннотация:

Текст статьи не публикуется в открытом доступе в соответствии с политикой журнала.

Исследована скорость распада интермедиата биолюминесцентной реакции бактерий 4a-гидропероксифлавина в зависимости от вязкости среды. Обнаружено, что при низких концентрациях глицерина и сахарозы (вязкость 1.1–1.3 сП) скорость распада увеличивается, а дальнейший рост вязкости до 6.2 сП приводит к уменьшению скорости распада по степенному закону с показателем 0.82–0.84. Методами молекулярной динамики установлено, что в средах с глицерином и сахарозой происходит изменение подвижности аминокислотных остатков активного центра люциферазы, отвечающих за связывание флавина. Полученные результаты говорят о двух разнонаправленных эффектах вязких сред с добавлением глицерина и сахарозы: 1) дестабилизация 4a-гидропероксифлавина за счет изменения структурно-динамических свойств белка, 2) стабилизация этого интермедиата за счет снижения скорости диффузии продуктов его распада.

Ключевые слова:
бактериальная люцифераза, биолюминесценция, вязкое микроокружение, метод остановленного потока, метод молекулярной динамики, интермедиат ферментативной реакции, диффузионное ограничение

Тип: Journal Article