В работе предложены метод и алгоритмы решения системы уравнений многофазной фильтрации, позволяющие моделировать капиллярно-гравитационную сегрегацию пластовых флюидов. Данные методики позволяют приводить уравнения фильтрации к более простому виду и существенно уменьшать машинное время расчетов при численном моделировании миграции углеводородов. Результаты работы продемонстрированы на тестовых примерах.