Полиморфизм сортов яблони, сказывающийся в размерах, форме, окраске, химическом составе плодов, в большей степени проявляется в семенном потомстве. Используя элементы ранней диагностики, можно оценить генотип деревьев уже на ранних этапах онтогенеза. В коллекции Ботанического сада им. Вс. М. Крутовского в настоящее время сохраняется богатый генофонд яблони, являющийся базой селекционных исследований.