Злокачественные опухоли женской репродуктивной системы являются наиболее распространенными онкологическими заболеваниями в женской популяции. К счастью современные скрининговые диагностические методы позволяют выявлять рак молочной железы, 1 шейки матки, эндометрия и др. на ранних стадиях. Все это, естественно, снижает онкологическую смертность в женской популяции и, одновременно, позволяет использовать менее агрессивные методики при лечении пациентов. Однако существующие на сегодняшний день системы определения прогноза заболевания, такие как TNM классификация, часто дополняемая иными факторами прогноза в зависимости от локализации и морфологии опухоли, включающие «классические» факторы прогноза (размер опухоли, наличие лимфогенного метастазирования, статус рецепторов стероидных гормонов и т.д.) не в состоянии обеспечить необходимую прогностическую точность для индивидуализации терапии. Именно по этой причине современная онкология столкнулась с парадоксальной ситуацией, когда современные высокотехнологичные методы лечения, в известной степени, обеспечивающие минимально радикальное воздействие на пациента, остаются недооцененными специалистами во многом в силу отсутствия точных прогностических моделей. Сегодня клиницисты нуждаются в новых, более точных прогностических моделях, способных индивидуализировать терапию, при этом степень ее индивидуализации прямо пропорциональна точности прогноза. Определение профиля экспрессии генов позволяет определить и количественно оценить фенотип опухоли на уровне мРНК. В большом количестве работ описано изменение экспрессии генов в процессе малигнизации, однако для клинического применения в качестве дополнительного фактора прогноза одобрено всего несколько таких систем. В данном обзоре рассматривается изменение экспрессии генов при раке молочной железы, шейки матки и эндометрия, а также возможность применения в клинической практике данной информации.