В статье предложен подход, позволяющий производить оценку альтернативных вариантов (проектов) инвестиционных программ развития предприятий наукоемкого сектора промышленности не только в количественных, но и в качественных (порядковых) шкалах. Авторами предлагается постановка задачи выбора эффективной инвестиционной программы развития на основе комплекса экономико-математических моделей, что позволит учесть множество разнородных факторов, включая субъективные, для принятия окончательного решения. При таком подходе эффективная инвестиционная программа развития будет являться результатом окончательного выбора из множества Парето (эффективных решений) путем его последовательного сужения.