В статье разбираются противоречия и трудности, с которыми сталкиваются и столкнутся в будущем государство и российские университеты при реализации приоритетного проекта «ВУЗы как центры пространства создания инноваций». Рассматриваются масштабы соблазна сугубо государственного регулирования академической среды, превращения образования и науки в глобальный товар, актуальность соблюдения баланса между академическим консерватизмом и управленчески-бюрократическим и экономическим радикализмом, с одной стороны, с другой - возрождения академического и творческого климата в стенах университетов, как базовой их ценности. Рассматриваются направления разработки стратегии поддержания и удержания престижа ВУЗов, формирования положительной репутации образовательных университетских заведений, как условия адекватного ответа на политические и экономические вызовы внутри страны и в мире.